La implementación de los laboratorios de ciencias hoy en día son de gran importancia en los colegios, pues permite a los estudiantes adquirir conocimientos a través de la experiencia mediante ensayo y error logrando que apliquen el método científico.
Por esta razón el Colegio San Antonio cuenta con un laboratorio de ciencias para apoyar la formación académica de sus alumnos en el área de las ciencias contando con instrumentos y materiales para que a través de la experimentación puedan lograr habilidades tales como trabajo en equipo, la comunicación y hasta liderar un grupo.
EL laboratorio de ciencia tiene una capacidad para 45 alumnos más el profesor, cuenta con herramientas y materiales, además de equipos tecnológicos para apoyar las clases (computador con conexión a internet y proyector)